一、轄區範圍（總計39,310公頃）

陸域：
北以青山漁港南堤為界，東側沿七股潟湖堤防，至七股溪一帶東側以七股大排水為界，南至鹽水溪南岸安平堤防，西至各沿海沙州為範圍，包括鹽水溪、曾文溪沿海公有地、黑面琵鷺保護區、七股潟湖等區域，面積4950公頃。

海域：
沿國家公園陸域外，海域等深線20公尺範圍加上鹽水溪至東吉嶼南端所形成之寬5公里，長約54公里之海域，也就是漢人先民渡台主要航道中，東吉嶼至鹿耳門段為範圍，面積34405公頃。

二、組織編制

本隊置有隊本部及4個外勤小隊，各小隊駐地詳列如下：
(一) 隊部小隊、青鯤鯓小隊及黑面琵鷺站小隊位於台南市安平區。
(二) 六孔小隊位於台南市七股區。
現有員額計36人（尚缺技佐1人、隊員1人、書記1人）。

三、任務職掌

依據內政部警政署國家公園警察大隊組織條例第二條之規定：
本大隊執行國家公園警察任務；其依國家公園法令執行職務時，並受事業主管機關就其主管業務指揮、監督之。
及同法第三條本大隊掌理事項為︰
(一) 關於國家公園區域內治安秩序之維護及災害急難之搶救事項。
(二) 關於國家公園區域內自然資源及環境之保護事項。
(三) 關於協助處理違反國家公園法令有關事項。
(四) 其他有關警察法令及警察業務事項。

四、工作重點

(一) 加強查緝園區內非法濫墾及破壞生態環境案件，積極保護園區內野生動、植物棲息環境。
(二) 針對本轄遊客眾多之地區執行安全維護及交通疏導工作，加強各遊憩區、停車場、魚塭區等地防搶與防竊勤務，以防止民眾財物遭受損失。
(三) 加強查緝、取締轄內各生態保護區及河川、溪流毒、電、炸魚等違反漁業法案件，以維持園區生態平衡。
(四) 協助台江國家公園管理處處理關於違反國家公園法令有關事項，以維護特有景觀，防止不當開發及濫墾、濫建。